根据《物权法》的规定，不动产物权的设立、变更、转让何消灭，经依法登记，发生效力;未经登记，不发生效力。因此，如果办理产权登记，登记的是对方的名字，对该房屋有完全的处分权。而私下签订的出资协议，只是一种债权，不发生物权的效力。建议双方到登记机构办理共有权登记手续。
办理流程：
首先要到地税局设在房产交易大厅一楼的二号、三号契税窗口评税,同时到住宅专项维修资金管理中心设的窗口缴纳维修资金,然后再到二楼办理查档。
查档和报税可同时进行。业主可在4个工作日后纳税窗口缴纳税费,取得税票后再到二楼提交办证所需材料,窗口初审后申请人手执受理单。业主根据受理单上的办证时限要求就可以拿到房产证。
二手房办理房产证的流程与商品房大致相同,只是增加了到地税局设在房产交易大厅一楼的六号、七号地税窗口评税的程序。
