股权转让协议无效的情形主要包括：
1.违反公司章程规定。如果公司章程对于股权转让有特殊规定，而转让行为未遵循这些规定，那么该转让行为将被认定为无效。
2.违反法律法规。股权转让协议若违反《公司法》等相关法律法规，也将导致协议无效。
3.违反特别规定。例如，根据《企业国有产权转让管理暂行办法》，国有股权转让需要经过主管部门的审批。如果未经审批就进行转让，那么该转让行为也将被认定为无效。
瑕疵股权转让的法律效力主要取决于受让人的知情情况：
1.受让人明知或应知出资瑕疵而接受转让。
在这种情况下，如果转让人已向受让人如实告知股权存在的瑕疵，并且受让人同意受让股权，那么双方之间的股权转让协议应当被认定为有效。
2.受让人未被告知或不明知瑕疵情况。
如果出让人在转让股权时未告知受让人股权存在的瑕疵，并且受让人对此并不知情或不应知情，那么受让人有权以欺诈为由主张撤销转让合同。
公司股权转让的情形主要包括以下几种：
1.股东之间转让股权。股东之间可以相互转让其全部或部分股权，这是最常见的股权转让情形。
2.股东向股东以外的人转让股权。股东向股东以外的人转让股权时，需要经过其他股东过半数的同意，并遵循公司章程的相关规定。
3.股权的强制执行而引起的转让。在某些情况下，股权可能会被法院强制执行而进行转让。
4.异议股东行使回购请求权引起的股权转让。当股东对公司的某些决议持有异议时，他们可能会行使回购请求权，从而引发股权转让。
5.股东资格的继承取得引起的股权法定转让。当股东去世时，其股权可能会由其继承人继承，从而引发股权的法定转让。
总之，股权转让是一项复杂的法律行为，需要遵循公司章程、法律法规等相关规定。在进行股权转让时，各方应当充分了解相关法律法规和规定，确保转让行为的合法性和有效性。
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