经济适用房房产证和商品房产证主要有以下区别：
1.产权性质：经济适用房属于保障性质的房产，产权证上会标注为经济适用房；而商品房产权证则无特殊标注，即为普通住宅，产权比较完整。
2.出售费用：经济适用房在出售时，购买人需要按经济适用房所在地标定地价的10%交纳土地出让金。没有标定地价的，土地出让金的价款暂按房屋售价的3%交纳。而商品房的产权证书拥有完整的房屋产权，在不违反法律规定的情况下，可以自由地转让、出租或赠与，其收益全部归个人所有，购买人除税费外不需要交其他的费用。
3.上市交易：职工个人购买的经济适用房，房屋产权归职工个人所有，已取得合法产权证书，即可依法进入二级市场上市交易。上市后，其收益全部归个人所有。经济适用房的产权证书所拥有的权利和普通商品房基本一样，唯一不同的是，经济适用房在出售时需要交纳土地出让金。
1.当事人需要携带身份证、户口本和还建房的购买合同到房屋登记管理部门提交材料，申请登记；
2.房屋登记管理部门需要对当事人提交的材料进行审核和查证；
3.对于合法合规并符合房产证办理条件的申请进行登记，发放房屋产权证书。
需要30个工作日内。
找法网提醒您，根据《不动产登记暂行条例》第二十条的规定，不动产登记机构应当自受理登记申请之日起30个工作日内办结不动产登记手续，法律另有规定的除外。
第二十一条规定，登记事项自记载于不动产登记簿时完成登记。
不动产登记机构完成登记，应当依法向申请人核发不动产权属证书或者登记证明。
