公司合并与收购的区别在于：
1.公司合并与股权收购的主体不同。
公司合并是公司间的行为，主体是参加合并的各公司。公司合并要由参加合并的各公司作出决议，要有合并各方公司签订协议。股权收购是收购公司与目标公司的股东之间的交易行为，主体是收购公司与目标公司股东。
2.公司合并与股权收购的效力不同。
公司合并的效力使公司实体发生变化，被并公司解散，丧失法律人格。收购的效力使目标公司控股股东发生变化，目标公司本身不发生变化，依然存续。
3.公司合并与股权收购的性质不同。
公司合并须由双方达成合并协议，是双方平等协商、资源合作的结果。合并公司与被合并公司处于“友好”关系中。在股权收购中，收购者与被收购的目标公司的关系就不尽一样。
4.公司合并与股权收购的控制程度不同。
公司合并中，被并公司完全并入存续公司或新设公司，后者取得被并公司的全部财产、权利义务，被并公司作为存续公司、新设公司的一部分而完全受其控制。股权收购中，收购方既可以收购目标公司的全部股份，进而完全控制目标公司，也可以只收购的目标公司50%以上的股份，而取得对目标公司的控制权，实现拥有控制权下的“合资经营”。
公司合并要注意以下问题：
1.换股比例的约定及调整；
2.员工补偿、安置条款；
3.违约责任及赔偿、补偿条款；
4.公司合并生效的前提条件；
5.合并后责任的承担。
找法网提醒您，根据《中华人民共和国公司法》第一百七十四条公司合并时，合并各方的债权、债务，应当由合并后存续的公司或者新设的公司承继。
公司进行了合并或者收购，那么原有公司所负的债务将不再由自己独立承担，而是由并购或者是收购之后的公司进行承担。这也可以叫做债务的继承。根据相关法律规定，在收购前，应当注意被收购公司的财产情况。被收购的企业，应当解散，并进行工商注销登记。
