农村土地承包纠纷仲裁程序有：
1.当事人撰写仲裁协议，明确仲裁请求;
2.向土地所在地的仲裁委提交仲裁申请，仲裁委确认受理后选定仲裁员组成仲裁庭开庭审理。
3.作出裁决。
找法网提醒您，《农村土地承包经营纠纷调解仲裁法》第三条发生农村土地承包经营纠纷的，当事人可以自行和解，也可以请求村民委员会、乡（镇）人民政府等调解。
第四条当事人和解、调解不成或者不愿和解、调解的，可以向农村土地承包仲裁委员会申请仲裁，也可以直接向人民法院起诉。
1.申请人与纠纷有直接的利害关系；
2.有明确的被申请人；
3.有具体的仲裁请求和事实、理由；
4.属于农村土地承包仲裁委员会的受理范围。
为二年，自当事人知道或应当知道权利受到侵害之日起计算。
根据《农村土地承包经营纠纷调解仲裁法》第十八条的规定，土地承包经营纠纷申请仲裁的时效期间为二年，自当事人知道或应当知道权利受到侵害之日起计算。
第二十一条规定，当事人申请仲裁，应当向纠纷涉及的土地所在地的农村土地承包仲裁委员会递交仲裁申请书。仲裁申请书可以邮寄或者委托他人代交。仲裁申请书应当载明申请人和被申请人的基本情况，仲裁请求和所根据的事实、理由，并提供相应的证据和证据来源。
书面申请确有困难的，可以口头申请，由农村土地承包仲裁委员会记入笔录，经申请人核实后由其签名、盖章或者按指印。
