三方协议不签学校不给毕业证处理方法是：
1.了解相关法规：首先，了解所在国家或地区的法律法规，特别是关于教育和学位授予的规定。检查是否有法规要求学校必须签署三方协议才能颁发毕业证；
2.与学校沟通：与所在的学校或教育机构的相关部门进行沟通，详细了解他们要求签署三方协议的原因和依据。表达的疑虑和不同意的立场，并要求他们提供其他解决方案；
3.寻求法律援助：如果认为学校的要求违反了相关法律法规，可以考虑寻求法律援助。咨询当地的法律专业人士，了解权益和可行的法律途径；
4.向教育主管部门投诉：如果相信学校的要求是不合法的或不公平的，可以向当地的教育主管部门或相关监管机构投诉，并提供相关证据和情况说明。
找法网提醒您，三方协议属于合同的一种，违约金是否需要赔偿视情况而定，如果双方约定不支付违约金，毁约可以不用支付，但是双方约定支付违约金，毁约是要支付的，如果违约金的金额过高，当事人可以要求降低违约金的金额。
三方协议与劳动合同区别存在以下几个方面：
1.签订时间不同：
三方协议：应在毕业生就业之前签订。
劳动合同：在毕业生到用人单位报到后才签订。
2.主体不同：
三方协议：适用于应届毕业生与用人单位、学校三方之间，学校是就业协议的鉴证方或签约方，就业协议对用人单位的性质没有规定，适用任何单位；
劳动合同：只适用于劳动者（含应届毕业生）与用人单位（不含公务员单位和比照实行公务员制度的组织和社会团体以及军队系统）之间，与学校无关。
3.内容不同：
三方协议：内容主要是毕业生如实介绍自身情况，并表示愿意到用人单位就业、用人单位表示愿意接受毕业生，学校同意推荐毕业生并列入就业方案，而不涉及毕业生到用人单位报到后应享有的权利义务。
劳动合同：主要内容涉及劳动报酬、劳动保护、工作内容、劳动纪律等方方面面，劳动权利义务更为明确。
4.目的不同；
5.其它。
