新生儿办理农村合作医疗生效时间是自出生之日起三个月内有效。
1.新生儿只有在出生三个月内买保险才能立即生效。
2.超过三个月不满一年买的保险次月生效。
3.超过一年买的保险次年1月1日生效。新生儿医保报销需要带的材料如下:门诊发票原件，门诊发票上无具体诊疗项目与药品项目的(须项目包含单价与数量)，或项目不完整的，须提供完整门诊医疗费清单;住院发票原件，住院医疗费汇总清单，出院小结或记录。
1.为新生儿办理入户手续。
2.携带相关材料，前往当地新农合经办机构，申请办理新农合证。在办理参保手续时，需要向工作人员提供户口本、出生证等材料的原件和复印件。
3.由工作人员对材料审核，审核通过即可缴纳新农合的参保费用。
4.收到新型农村合作医疗证。
找法网提醒您，新生儿使用新农合报销，需要住院才能报销。需要在医院办理住院证，然后前往当地新农合机构开具无卡证明，并交给医院的相关部门，出院结算时，可直接使用新农合报销，并支付剩余的治疗费用。
《中华人民共和国社会保险法》第二十四条
国家建立和完善新型农村合作医疗制度。
新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。
