处理知识产权纠纷的方法如下：
1.知识产权纠纷发生后，双方自行协商；
2.知识产权纠纷发生后，经双方申请，由人民法院、仲裁机构或者调解人协调；
3.知识产权纠纷发生后，当事人或者非特定第三人要求知识产权行政机关处理知识产权纠纷；
4.知识产权纠纷发生后，将纠纷提交仲裁机构审理，仲裁机构制定对纠纷双方都有约束力的裁决制度；
5.知识产权纠纷发生后，向法院起诉。
常见纠纷有：归属纠纷、侵权纠纷、合同纠纷、行政纠纷。
1.以事实为根据，以法律为准绳的原则；
解决知识产权纠纷，必须以事实为根据，以法律为准绳。这一原则是解决知识产权纠纷最基本、最核心的原则。以事实为根据，就是要实事求是，一切从实际出发，全面客观地认定事实，忠于事实的真相。
2.当事人在适用法律上一律平等的原则；
当事人在适用法律上一律平等，是宪法所确立的“中华人民共和国公民在法律面前一律平等”的原则在解决知识产权纠纷中的具体体现。
找法网提醒您，知识产权诉讼的时效是是三年。根据相关规定，侵犯专利权、著作权、商标权的诉讼时效为三年。并且该诉讼时效自利权人或者相关利害关系人知道或者应当知道侵权行为以及侵权人之日起计算。
《中华人民共和国专利法》第七十四条
侵犯专利权的诉讼时效为三年，自专利权人或者利害关系人知道或者应当知道侵权行为以及侵权人之日起计算。
发明专利申请公布后至专利权授予前使用该发明未支付适当使用费的，专利权人要求支付使用费的诉讼时效为三年，自专利权人知道或者应当知道他人使用其发明之日起计算，但是，专利权人于专利权授予之日前即已知道或者应当知道的，自专利权授予之日起计算。
