农村违建房屋处理的方式如下：
1.对于农村违法的建筑，乡、镇人民政府应命令其停止施工、在规定的时间内改正；
2.逾期还是不改正的，拆除解决。
3.擅自将农用地用来建设房屋等的，违反土地利用总体规划的，人民政府土地行政主管部门有权实施以下处罚：
(1)拆除新建在非法转让的土地上的房子等和其他设施、恢复土地原来的状况；
(2)没收不符合土地利用总体规划的、新建在非法转让的土地上的建筑物和其他设施；
(3)并罚款。
找法网提醒您，根据《城乡规划法》第六十四条未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；
尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；
无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。
1.未申请或申请未获得批准，未取得建设用地规划许可证和建设工程规划许可证而建成的建筑；
2.擅自改变建设工程规划许可证的规定建成的建筑；
3.擅自改变了使用性质建成的建筑；
4.擅自将临时建筑设成为永久性建筑。
法律规定拆除违建由土地行政主管部门执行。违建房屋应该由土地行政主管部门、城乡规划主管部或建设行政主管部门执行强拆。违章建筑不合乎法律规定，城乡规划主管部门作出责令停止建设或者限期拆除的决定后，当事人不停止建设或者逾期不拆除的，建设工程所在地县级以上地方人民政府可以责成有关部门采取查封施工现场、强制拆除等措施。
