三方协议书与劳动合同的区别主要有：
1.含义不同：三方协议是毕业生与用人单位签订的就业协议，它的效力在毕业生到用人单位报到，签订劳动合同的时候正式终止。劳动合同是指劳动者与用工单位之间确立劳动关系，明确双方权利和义务的协议。
2.签订的主体不同：三方协议涉及学校、用人单位、学生等三方面，三方相互关联但彼此独立；而劳动合同是双方合同，由劳动者和用人单位两方签订。
3.主体身份不同：毕业生签订就业协议时仍然是学生身份，但是签订劳动合同时应当是劳动者身份。
4.有效期限不同：三方协议的有效期为自签约日起至毕业生到用人单位报到之日。而劳动合同的有效期根据双方的约定为准。
毕业生三方协议违约的处理方式是如果三方协议有约定违约责任的，按约定承担。没有约定的，按实际造成损失赔偿。
找法网提醒您，根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条 【违约责任】当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的,应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
第五百八十三条 【违约损害赔偿责任】当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的,在履行义务或者采取补救措施后,对方还有其他损失的,应当赔偿损失。
毕业时的三方协议不是必须签。
三方协议是《全国普通高等学校毕业生就业协议书》的简称，它是明确毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式，法律没有要求毕业生必须签订三方协议。
《劳动合同法》第十条规定，建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。
已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。
用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。
