工程竣工验收不合格处理方法是：
1.要求进行修复；
2.修复后的建设工程经竣工验收合格，发包人请求承包人承担修复费用的，应予支持；
3.修复后的建设工程经竣工验收不合格，承包人请求支付工程价款的，不予支持，因建设工程不合格造成的损失，发包人有过错的，也应承担相应的民事责任。
《民法典》第七百九十九条
建设工程竣工后，发包人应当根据施工图纸及说明书、国家颁发的施工验收规范和质量检验标准及时进行验收。验收合格的，发包人应当按照约定支付价款，并接收该建设工程。建设工程竣工经验收合格后，方可交付使用；未经验收或者验收不合格的，不得交付使用。
找法网提醒您，工程竣工验收需要提供以下资料：工程概况表、工程竣工总结、单位(子单位)工程质量竣工验收记录、单位(子单位)工程质量控制资料核查记录、单位(子单位)工程安全和功能检验资料核查及主要功能抽查记录、竣工图等。
《建设工程质量管理条例》
第十六条 建设单位收到建设工程竣工报告后，应当组织设计、施工、工程监理等有关单位进行竣工验收。建设工程竣工验收应当具备下列条件：
(一)完成建设工程设计和合同约定的各项内容;
(二)有完整的技术档案和施工管理资料;
(三)有工程使用的主要建筑材料、建筑构配件和设备的进场试验报告;
(四)有勘察、设计、施工、工程监理等单位分别签署的质量合格文件;
(五)有施工单位签署的工程保修书。
建设工程经验收合格的，方可交付使用。
工程竣工验收内容如下：
1.检查工程是否按批准的设计文件建成，配套、辅助工程是否与主体工程同步建成；
2.检查工程质量是否符合国家和铁道部颁布的相关设计规范及工程施工质量验收标准；
3.检查工程设备配套及设备安装、调试情况，国外引进设备合同完成情况；
4.检查概算执行情况及财务竣工决算编制情况；
5.检查联调联试、动态检测、运行试验情况等等。
