知识产权纠纷按照如下方式处理是正确的：
1.协商。知识产权纠纷当事人双方协商后，对纠纷问题有了一个解决方式，达成一个和解协议。
2.调解。知识产权纠纷当事人一方或者双方申请，由法院、仲裁机构或调解人在当事人进行协调，之后对纠纷达成协议，解决知识产权纠纷。
3.处理。这个是到知识产权行政管理机关处进行处理，也就是处理知识产权纠纷或者与知识产权有关的侵权行为等违法行为的活动。
4.仲裁。首先当事人愿意通过仲裁，将纠纷提交给仲裁机构进行审理，然后仲裁机构对双方争议的地方进行处理，作出仲裁裁决或者调解书。之后由知识产权纠纷的当事人进行履行。
5.诉讼。双方当事人对知识产权纠纷问题不能够协商、调解等情况下，当事人可以到法院进行起诉。因为这种方式，是最有力，最能够让对方信服的方式。
找法网提醒您，知识产权诉讼的时效是是三年。根据相关规定，侵犯专利权、著作权、商标权的诉讼时效为三年。并且该诉讼时效自利权人或者相关利害关系人知道或者应当知道侵权行为以及侵权人之日起计算。
《中华人民共和国专利法》第七十四条
侵犯专利权的诉讼时效为三年，自专利权人或者利害关系人知道或者应当知道侵权行为以及侵权人之日起计算。
发明专利申请公布后至专利权授予前使用该发明未支付适当使用费的，专利权人要求支付使用费的诉讼时效为三年，自专利权人知道或者应当知道他人使用其发明之日起计算，但是，专利权人于专利权授予之日前即已知道或者应当知道的，自专利权授予之日起计算。
一般是按照被侵权人遭受的实际损失确定，如果无法确定损失的，则按照侵权人获利的情况确定。获利的情况无法确定的，双方可以协商赔偿数额。
侵害他人人身权益造成财产损失的，按照被侵权人因此受到的损失或者侵权人因此获得的利益赔偿，被侵权人因此受到的损失以及侵权人因此获得的利益难以确定，被侵权人和侵权人就赔偿数额协商不一致，向人民法院提起诉讼的，由人民法院根据实际情况确定赔偿数额。
侵犯知识产权的，侵权人应当按照权利人因此受到的实际损失或者侵权人的违法所得给予赔偿， 权利人的实际损失或者侵权人的违法所得难以计算的，可以参照该权利使用费给予赔偿。 对故意侵犯著作权或者与著作权有关的权利，情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的一倍以上五倍以下给予赔偿。
