宅基地被别人侵占，可以先协商解决；如果双方当事人无法通过协商解决的，可以请求人民政府处理。政府部门也无法调解的情况下，宅基地使用权纠纷是民事纠纷，被侵权方可以考虑向人民法院起诉处理。
宅基地使用权纠纷的诉讼流程是：
1.原告起诉；
2.法院受理后，将起诉书副本送达被告；
3.被告在十五日内提交答辩状，法院在五日内，将答辩状副本送达原告。如果被告不提交答辩状，不影响审理；
4.决定开庭审理的案件，法院在三日前通知当事人并公告；
5.法庭调查阶段包括当事人陈述，告知证人的权利义务，证人作证，宣读未到庭的证人证言。出示书证、物证和视听资料，宣读鉴定结论，宣读勘验笔录；
6.法庭辩论包括原告及其诉讼代理人发言，被告及其诉讼代理人答辩，第三人及其诉讼代理人发言或者答辩，互相辩论。法庭辩论终结，由审判长按照原告、被告、第三人的先后顺序征询各方最后意见；
7.法庭辩论终结，应当依法作出判决。判决前能够调解的，还可以进行调解，调解不成的，应当及时判决；
8.判决宣告。
农村的宅基地所有权归农民集体所有。
根据《土地管理法》第九条规定，城市市区的土地属于国家所有。
农村和城市郊区的土地，除由法律规定属于国家所有的以外，属于农民集体所有；宅基地和自留地、自留山，属于农民集体所有。
找法网提醒您，拆迁纠纷有时效限制，时效限制为六个月。当事人应当在诉讼时效范围内提出诉讼请求，时效自知道或者应当知道作出行政行为之日或被侵害之日起算，超过二十年的拆迁纠纷法院不予受理。
《中华人民共和国行政诉讼法》第四十六条
公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。法律另有规定的除外。
因不动产提起诉讼的案件自行政行为作出之日起超过二十年，其他案件自行政行为作出之日起超过五年提起诉讼的，人民法院不予受理。
