确保著作权侵权案件中的证据全面有效的方法是：
当事人应当收集相关证据，证明他人正在实施或者即将实施侵犯其权利、妨碍其实现权利的行为，如不及时制止将会使其合法权益受到难以弥补的损害的事实存在。当事人向法院提出保全申请。法院确认属实的予以保全。
《中华人民共和国著作权法》第五十七条
为制止侵权行为，在证据可能灭失或者以后难以取得的情况下，著作权人或者与著作权有关的权利人可以在起诉前依法向人民法院申请保全证据。
1.举证期限可以由当事人协商一致，并经人民法院认可。
2.由人民法院指定举证期限的，第一审普通程序案件不得少于15日，当事人提供新的证据的第二审案件不得少于10日。
3.当事人应当在举证期限内向人民法院提交证据材料，当事人在举证期限内不提交的，视为放弃举证权利。
4.当事人增加、变更诉讼请求或者提起反诉的，应当在举证期限届满前提出。
5.当事人变更诉讼请求的，人民法院应当重新指定举证期限。
找法网提醒您，侵犯著作权情形有：
1.未获得著作权人许可，擅自出卖、发表、出版其作品的；
2.歪曲、篡改他人作品的；
3.没有参加创作，为谋取个人名利，在他人作品上署名的；
4.歪曲、篡改他人作品的；
5.剽窃他人作品的。
