合作协议书注意事项主要有：
1.理清合伙人的职责、议事规则、出资份额、如何分红以及退出机制；
2.审查合伙人的主体资格，若合作方是企业，需要保留其营业执照复印件；若合作方是个人，应详细记录其家庭住址、电话、身份证号码等信息；
3.命名合伙企业时，不得包含“有限”或者“有限责任”字样；
4.明确约定合伙人各自的权利与义务。
个人与公司签合作协议合法。个人和公司签合作合同，满足下列条件就是有效的：
1.当事人具有相应的民事行为能力。自然人签订合同，原则上须有完全行为能力，限制行为能力人和无行为能力人不得亲自签订合同，而应由其法定代理人代为签订。非自然人必须是依法定程序成立后才具有合同行为能力。
2.当事人意思表示真实。缔约人的表示行为应真实地反映其内心的效果意思。
3.不违反法律或社会公共利益。
4.合同标的须确定和可能。合同给付可能实现，合同标的自始确定，或可得确定。
合作协议和合同的区别如下：
1.合同有违约责任的规定，协议书没有。
2.经济合同有“民法典”作为依据，协议书暂时没有具体法规规定。
3.协议书比合同应用范围广，项目往往比合同项目要大，内容不如合同具体。因此，协议书签订以后，往往还要分项签订一些专门合同。
找法网提醒您，《中华人民共和国民法典》第四百六十四条合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。婚姻、收养、监护等有关身份关系的协议，适用有关该身份关系的法律规定；没有规定的，可以根据其性质参照适用本编规定。
