承包合同出现纠纷的，可以按以下方式处理纠纷：
1.当事人自行协商解决；
2.可以通过纠纷当事人之外的第三者，促成纠纷主体相互谅解、妥协，从而达成最终解决纠纷的合意；
3.调解不成，将纠纷提交仲裁机构，一方不履行仲裁裁决，对方可以申请法院强制执行。
4.一方向法院提出请求，由法院裁决纠纷的制度。
法律依据：《中华人民共和国民法典》第十条
处理民事纠纷，应当依照法律；法律没有规定的，可以适用习惯，但是不得违背公序良俗。
找法网提醒，工程承包合同产生纠纷的，向人民法院起诉的时效是3年，从纠纷产生时开始计算。
《中华人民共和国民法典》
第一百八十八条
【普通诉讼时效、最长权利保护期间】向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
签订承包合同注意事项主要有：
1.仔细阅读使用的合同文本，掌握有关建设工程施工合同的法律、法规规定；
2.严格审查发包人签约主体资格、资质等级及履约信用；
3.使用准确术语来表述工期、质量、造价等施工合同重要条款的约定；
4.对工程进度拨款和竣工结算程序做出详细规定，避免使用含糊不清易产生误解或歧义的表述；
5.合理限制三方协议、债权转让协议在分包合同中的应用；
6.明确规定监理工程师及双方管理人员的职责和权限。
