土地确权纠纷，由当事人协商解决;协商不成的，由人民政府处理;单位之间的争议，由县级以上人民政府处理;个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起30日内以作出处理决定的人民政府为被告提起行政诉讼。
土地确权的进行需要向村委会递交书面申请、填写申请表；村委会签署意见签字盖章交由乡镇政府审核；乡镇政府根据上报资料现场勘测，审查合格上报县国土资源局；县国土资源局接件后进行资料审核，到现场进行勘测；审核合格报县政府进行审批，公示无异议确权发证。
《土地管理法实施条例》第三条
国家依法实行土地登记发证制度。依法登记的土地所有权和土地使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。土地登记内容和土地权属证书式样由国务院土地行政主管部门统一规定。土地登记资料可以公开查询。
找法网提醒您，土地确权后被征用补偿款的归属需视情况而定：
1.土地征收后的土地补偿款归土地所有人所有。即征收农村土地的，土地补偿款归村集体所有，不是给农民的补偿；
2.对于土地征收中青苗补偿费、地上附着物补偿费等，归青苗或者地上附着物的所有人享有。即属于实际耕种土地的农民享有；
3.对于土地征收中的安置补助费，由享有安置权利的村民享有，直接发放到村民手中。
