分公司注销的流程：
1.股东会决议解散分公司；
2.对分公司进行查账；
3.向该分公司的公司登记机关申请注销登记。
注销公司费用大概费用需要根据具体情况确定，具体如下：
1.公司注销费用在登报和银行注销时候会存在费用，一般在几百到一千左右；
2.公司呈现运营异常或者一些工商方面的问题异常的，十分难处理，贵的要几万元至十几万元。
分公司注销登记所需准备材料如下：
1.公司法定代表人、指定代表或者共同委托代理人签署并加盖公司公章的《分公司注销登记申请书》;
2.公司签署、加盖公司公章并粘贴指定代表或共同委托代理人身份证复印件的《指定代表或者共同委托代理人的证明》，应标明具体委托事项、权限、委托期限。指定代表或共同委托代理人要提交身份证原件(供当场确认使用)。
3.公司出具的注明分公司注销原因的注销决定。
4.分公司的《营业执照》正、副本。
5.分公司完税证明。您所说的“税务系统中好像还处于非正常状态”如果是指没有进行税务登记，可以提交领取营业执照时工商登记机关核发的办理税务登记使用的那联“分公司登记核准通知书”作为证明。
6.分公司如单独开设有银行账户的，还必须要提交银行清户证明。
7.分公司公章。
分公司注销的条件如下：
1.公司被依法宣告破产；
2.公司章程规定营业期限届满或者其他解散事由出现；
3.公司因合并、分立解散；
4.公司被依法责令关闭。
找法网提醒您，根据《中华人民共和国公司法》第六条的规定，设立公司，应当依法向公司登记机关申请设立登记。符合本法规定的设立条件的，由公司登记机关分别登记为有限责任公司或者股份有限公司；不符合本法规定的设立条件的，不得登记为有限责任公司或者股份有限公司。
法律、行政法规规定设立公司必须报经批准的，应当在公司登记前依法办理批准手续。
公众可以向公司登记机关申请查询公司登记事项，公司登记机关应当提供查询服务。
