处理公司员工投诉劳动纠纷的方法有：
1.协商处理：劳动者与用人单位通过协商解决争议。
2.申请调解：向劳动争议调解委员会申请调解。
3.申请仲裁：将纠纷提交劳动争议仲裁委员会由仲裁委依法开庭审理，并作出仲裁裁决。
4.提起诉讼：自收到仲裁裁决书之日起15日内向人民法院提起诉讼。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法：
(一)因确认劳动关系发生的争议;
(二)因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议;
(三)因除名、辞退和辞职、离职发生的争议;
(四)因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议;
(五)因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议;
(六)法律、法规规定的其他劳动争议。
劳动争议仲裁时效是一年。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条规定，申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。
劳动争议仲裁一般是公开的，但双方协议不公开或者涉及到国家秘密、商业秘密和个人隐私的除外。找法网提醒您，具体如下：
1.劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受规定的仲裁时效期间的限制；
2.劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出，当事人及代理人可以到劳动仲裁委员会查阅、复印劳动仲裁案件裁决书。
