检察院不予起诉的案件不一定是结束了。检察院决定不起诉，表明司法机关不再追究其刑事责任，除非之后有新的证据证明其构成犯罪。检察院决定不起诉，并不是代表完全不用承担其他责任，如果涉及行政违法，还要承担行政责任，如果造成他人损失等，还要承担民事赔偿相关责任。
《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百八十条
对于有被害人的案件，决定不起诉的，人民检察院应当将不起诉决定书送达被害人。被害人如果不服，可以自收到决定书后七日以内向上一级人民检察院申诉，请求提起公诉。人民检察院应当将复查决定告知被害人。对人民检察院维持不起诉决定的，被害人可以向人民法院起诉。被害人也可以不经申诉，直接向人民法院起诉。人民法院受理案件后，人民检察院应当将有关案件材料移送人民法院。
以下情况检察院不予起诉：情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的；其他法律规定免予追究刑事责任的。
《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条
依法不追诉原则有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
（一）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
（二）犯罪已过追诉时效期限的；
（三）经特赦令免除刑罚的；
（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；
（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；
（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。
找法网提醒您，被检察院决定不起诉决定的当事人是否会有案底，要视具体情况而定：
1.如果犯罪嫌疑人是因没有违法犯罪事实而被决定不起诉的，则不会有案底；
2.因犯罪情节轻微而被不起诉的，仍会有本应的案底记载。
