非法占用国家土地的处理是：当地人民政府的自然资源管理部门可以责令非法侵占人，立即退还非法占有的土地，如在非法侵占的土地上兴建了房屋以及建筑物，可以要求限期拆除并处以罚款的处罚措施。
找法网提醒您，根据《中华人民共和国土地管理法》第七十七条未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款；对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
超过批准的数量占用土地，多占的土地以非法占用土地论处。
非法占用土地罪的构成要件是：
1.客体要件，本罪侵犯的客体是国家土地管理、城市规划等机关的正常活动；
2.客观要件，本罪在客观方面表现为徇私舞弊，违反土地管理法规，滥用职权，非法占用土地，情节严重的行为；
3.主体要件，本罪的主体为国家机关工作人员；
4.主观要件，本罪在主观为故意。
非法占地最数量较大或者造成耕地大量毁坏的构成非法占地罪。“数量较大”，是指非法占用基本农田5亩以上或者非法占用基本农田以外的耕地10亩以上；“造成耕地大量毁坏”，是指行为人非法占用耕地造成基本农田5亩以上或者基本农田以外的耕地10亩以上种植条件严重毁坏或者严重污染。
《中华人民共和国刑法》第三百四十二条， 违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
