单位交医保和个人交医保有冲突，因为规定一个人只能拥有一个医保账户。医疗保险指通过国家立法，按照强制性社会保险原则基本医疗保险费应由用人单位和职工个人按时足额缴纳。不按时足额缴纳的，不计个人帐户，基本医疗保险统筹基金不予支付其医疗费用。
个人交的社保和单位交的不一样。单位交医保和个人交医保有的区别如下：
1.缴纳的险种不同：单位为员工缴纳的五险一金，包含养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险以及生育保险、住房公积金；个人缴纳社保只是养老保险和医疗保险。公司缴纳社保的概念是，法律强制规定公司必须为员工缴纳社保，公司缴纳的社保又叫城镇职工社保。不管是公司或是个人，都是强制性缴纳的，是双方的法定义务，具有法律效应。
2.缴费费用不同：公司缴纳社保，是公司缴纳大部分费用，职工缴纳小部分费用，生育保险和工伤保险由公司负责缴纳;个人缴纳社保只有养老和职工医保，自己缴纳费用要高很多，而且缴纳险种也很少。而个人缴纳的概念是，如果没有在公司或者单位中工作，是自由职业者或者是无业人员，就可以自己缴纳社保。这属于自愿行为，不带有强制性。个人缴纳的社保又叫城乡居民社保。
3.缴费基数不同：公司为员工缴纳社保是按照基本工资基数来算的；个人缴纳社保，缴费基数分为中、高、低档次，根据自身情况选择。
找法网提醒，报销流程如下：
参合农民持《新农合证》在定点机构门诊治疗，由定点医疗机构按《新农合证》家庭门诊帐户诊帐户现有的金额直接减免医药费用，超出部由参合农民自付。定点医疗机构应及时与农医所进行结算。参合农民在市、县、乡定点医疗机构住院治疗的，由该定点医疗机构进行直补。由定点医疗机构对其发生的医药费用进行审核，按实施办法规定标准垫付应补助金额。
