不合法。公司的处理方式是：
1.拒绝出具离职证明。依据相关法律的规定，员工未履行提前通知义务时，用人单位有权拒绝为其出具解除劳动合同的证明，可以在一定程度上预防员工不履行交接手续。
2.造成损失的，要求员工赔偿。员工未履行工作交接手续，而给用人单位造成经济锚点损失的，用人单位可以要求员工赔偿。但要注意，实践中用人单位需有证据证明存在经济损失，且经济损失与员工未履行交接手续间存在直接的因果关系。如员工恶意将公司某些重要文件、密码等物品及信息带走，造成公司业务停滞或遭受其它直接损失的，公司可以要求员工赔偿。
3.紧急情况下可以扣发工资。无论在何种情况下扣发工资在法律上都存在风险。但是，如果员工将公司的重要财物，如汽车、笔记本电脑、手机或其他重要信息带走拒不归还或拒不告知公司的，可能会给公司造成无法弥补的经济损失，那么公司可以适当扣发其工资。司法实践中，对于公司扣发工资的行为，往往是有权机关要求公司予以纠正，只有在公司拒不改正的情况下，才会处以罚则。
去当地人力资源和社会保障局（原劳动局）内的劳动争议仲裁委，申请劳动仲裁。需提交的材料：仲裁申请书2份、申请人身份证复印件1份；相关证据复印件和证据清单2份；部分地区还需要提供用人单位的工商登记信息。
提交材料后，一般5个工作日仲裁委给予立案，劳动仲裁委不收取费用。然后给双方举证期；之后开庭审理，并且对你们双方进行调解，调解不成仲裁委会下达裁决书；劳动仲裁60天内结案；对于裁决书不服，也可以起诉到法院。
如能进一步提出更加详细的信息，则可提供更为准确的法律意见。
找法网提醒您，拖欠工资欠条要包含以下内容：债务人和债权人的双方身份信息；欠款的数额，用途；是否给付利息；是否约定还款日期；债务人签字确认，并加盖公司公章；书写欠条的时间。
《中华人民共和国民法典》第六百六十七条
借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。
《中华人民共和国民法典》第六百六十八条
借款合同应当采用书面形式，但是自然人之间借款另有约定的除外。
借款合同的内容一般包括借款种类、币种、用途、数额、利率、期限和还款方式等条款。
