12000工资扣1145元个人所得税。工资超过个税起征点，是必须按照法律规定纳税的。工资范围在1-5000元之间的，包括5000元，适用个人所得税税率为0%；工资范围在5000-8000元之间的，包括8000元，适用税率为3%；工资范围在8000-17000元之间的，包括17000元，适用税率为10%。
补交个人所得税的方式如下：
1.补交个人所得税需要提供基本资料；
2.做好补交个人所得税的申报报表；
3.将申报报表提交到税务局，由税务局出具通用缴款书；
4.最后到银行去进行缴税。
找法网提醒您，根据《中华人民共和国个人所得税法》第十条有下列情形之一的，纳税人应当依法办理纳税申报：
（一）取得综合所得需要办理汇算清缴；
（二）取得应税所得没有扣缴义务人；
（三）取得应税所得，扣缴义务人未扣缴税款；
（四）取得境外所得；
（五）因移居境外注销中国户籍；
（六）非居民个人在中国境内从两处以上取得工资、薪金所得；
（七）国务院规定的其他情形。
个人所得税计算方法有：
1.应纳税所得额=税前工资收入金额-五险一金(个人缴纳部分)-费用减除额。
2.应纳税额=应纳税所得额×税率-速算扣除数。
