医疗纠纷协议书写应当包括以下内容：
1.双方当事人的基本情况及要求。包括当事人姓名、性别、年龄、住址、身份证号码、简要的治疗经过、陈述的主要意见、理由、申请鉴定时间等，医疗机构要载明医疗机构名称、地址、《医疗机构许可证》代码，医务人员要载明专业、专业技术任职资格、合法执业资格证书代码。
2.双方当事人协商的结果。调解结果至于固定下来才有约束力，对当事人同意的调解结果一定要写进调解协议书中。
3.对双方当事人的效力。
4.尾部。包括双方当事人及调节机构的签章以及日期等。
处理医疗纠纷的原则是：
1.过错责任原则，是指以行为人主观上有过错为承担民事责任的充要条件，即行为人仅在有过错的情况下，才承担民事责任，没有过错就不承担民事责任。在过错责任下，对侵权行为实行“谁主张，谁举证”的原则。找法网提醒您，受害人有义务举出相应证据表明加害人主观上有过错，以保障其主张得到支持。加害人过错的程度在一定程度上也会对其赔偿责任的范围产生影响。
2.推定过错责任，是指行为人致人损害时，如果不能证明自己没有过错，就要推定其有过错，并承担侵权责任。推定过错责任，仍以过错作为承担责任的基础，因而它并不是一项独立的归责原则，只是过错责任原则的一种特殊方式。对这类侵权行为，举证责任的分配一般采取“举证责任倒置”,但采用这一原则时，只能适用于法律有特别规定的情形。
1.人民调解
人民调解委员会的调解是指双方当事人共同向调解委员会申请调解，由后者主持调解达成协议。
2.行政调解
行政调解是指卫生行政部门对于医疗纠纷的调解。
3.诉讼调解也称司法调解，是指医疗纠纷进入诉讼程序后，由法院组织进行、医疗纠纷双方当事人自愿同意的调解。
