公司允许罚款是不合法的。
因为有相关的法律规定，行政执法机关才可以对公民的违法行为进行罚款，而公司并不属于行政执法机关，因此公司是没有权利对员工罚款的。员工工作时出现过错，公司想要处罚员工的，可以在劳动合同中约定员工未完成劳动定额或承包任务，公司可以发放最低工资或者要求其赔偿因此造成的损失。
如果公司对员工进行罚款的，员工可以去申请劳动仲裁来维权。因为有规定各级劳动行政部门有权监察用人单位工资支付的情况。用人单位有侵害劳动者合法权益行为的，由劳动行政部门责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金。
1.向劳动保障行政部门投诉、举报；
2.向调解组织申请调解；
3.依法向有管辖权的劳动争议仲裁委员会申请仲裁；
4.或者依法向人民法院提起劳动诉讼等。
法律依据为：《劳动保障监察条例》第十条
劳动保障行政部门实施劳动保障监察，履行下列职责：
（一）宣传劳动保障法律、法规和规章，督促用人单位贯彻执行；
（二）检查用人单位遵守劳动保障法律、法规和规章的情况；
（三）受理对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为的举报、投诉；
（四）依法纠正和查处违反劳动保障法律、法规或者规章的行为。
《劳动保障监察条例》第十四条
劳动保障监察以日常巡视检查、审查用人单位按照要求报送的书面材料以及接受举报投诉等形式进行。
《中华人民共和国劳动法》第七十七条
用人单位与劳动者发生劳动争议，当事人可以依法申请调解、仲裁、提起诉讼，也可以协商解决。
调解原则适用于仲裁和诉讼程序。
找法网提醒您，员工工作时出现过错，公司想要处罚员工的，可以采取以下办法：
1.在劳动合同中约定违纪发放最低工资：在劳动合同中约定员工未完成劳动定额或承包任务，公司可以发放最低工资。不过这里要注意的是，员工未按约定完成工作任务，公司发放最低工资时，不能低于当地最低工资标准。否则的话，这个条款不具有法律效力。
2.因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失：经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的百分之二十。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
3.在员工手册、规章制度中明确违纪处罚规定：在员工手册、规章制度中明确违纪处罚规定，并经公司员工同意。虽然按规定公司没有罚款的权利，但是可以在员工手册或是规章制度中规定，一旦员工出现违纪情况，可以向员工说明违纪及处罚情况。不过，这些处罚规定必须向员工们公示，并经员工同意，否则对员工无效。
4.开除违纪员工。
