农村拆迁补偿款纠纷处理流程如下：
1.准备好民事诉讼状。
2.到具有管辖权的人民法院起诉，并提交相关的证据材料。
3.按照人民法院的通知准时出席参与诉讼活动。
4.若不服一审判决或裁定，应在接到判决书后15天内或接到裁定书后10天内向原审人民法院或上一级人民法院提出上诉，并递交上诉状。
处理农村征地补偿纠纷首先应双方持公平原则进行协商；当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的可以向辖区内仲裁机构申请仲裁或提起行政诉讼、申请行政复议；仍未解决的，可以直接向人民法院提起诉讼。
征地补偿协议可以公开。国土资源部要求政府征收部门及时、全面、主动公开征地有关信息，包括国务院和省政府批准用地文件、拟征收土地公告、拟征收土地补偿安置方案、一书四方案、征收土地公告等内容，以确保被征地农民的知情权、参与权、表达权和监督权。
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十九条，房屋征收部门应当依法建立房屋征收补偿档案，并将分户补偿情况在房屋征收范围内向被征收人公布。审计机关应当加强对征收补偿费用管理和使用情况的监督，并公布审计结果。
一般来说，《房屋拆迁补偿协议书》一经签订，房屋拆迁当事人均应全面履行，不允许反悔。找法网提醒，但是，由于房屋拆迁涉及的法律关系比较复杂，在下面4种情况下，《房屋拆迁补偿协议书》可以反悔：
1.与房屋拆迁有关行政许可撤销或确认违法。
2.房屋估价机构违法或估价不合理。
3.协议存在重大误解、显失公平。
4.未成年人、限制行为能力人签的协议。
