工程施工索赔的程序如下：
1.承包商递交索赔意向书;
2.承包商继续施工，同时准备索赔材料;
3.提交索赔文件;
4.工程师审核索赔文件;
5.工程师作出处理决定;
6.业主审查索赔处理;
7.承包商是否接受最终索赔处理决定。
工程施工索赔的注意事项有：
1.索赔时效。索赔事件发生后，承包人必须在合同约定的时间内提出索赔。
2.承包人必须按照合同约定的程序进行，否则可能会丧失索赔利益的实现。
3.施工索赔实现的关键是承包人提供的证据确实充分。
4.施工索赔是单方主张权利要求，经对方签字确认后即成为工程签证，在双方未能协商一致的情况下，通过诉讼是施工索赔最后的救济手段。
找法网提醒您，工程索赔时间规定是三年。
工程索赔的时限是指各类标准施工合同通用条款中规定的，或者是承发包双方在施工合同中约定的提出索赔的时间限制。
《中华人民共和国民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
