企业合并后员工的处理方式是应当继续劳动合同，如果裁员的，应当对劳动者进行补偿。公司合并的方式有新设合并以及吸收合并。新设合并是指两个公司同时成为另一个公司，涉及到三个公司。
找法网提醒您，根据《公司法》第一百七十二条公司合并可以采取吸收合并或者新设合并。
一个公司吸收其他公司为吸收合并，被吸收的公司解散。两个以上公司合并设立一个新的公司为新设合并，合并各方解散。
第一百七十三条公司合并，应当由合并各方签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。
企业吸收合并有下列的程序：
1.制定合并方案，召开股东大会，经过参加会议的三分之二以上代表表决通过；
2.与被合并企业签订企业并购协议，并双方分别编制资产负债表和财产清单；
3.自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上至少公告三次；
4.办理工商变更登记手续。
《中华人民共和国公司法》第一百七十二条公司合并可以采取吸收合并或者新设合并。一个公司吸收其他公司为吸收合并，被吸收的公司解散。两个以上公司合并设立一个新的公司为新设合并，合并各方解散。
一切按照新公司要求。若新公司声明（有文件）合并后劳动关系重新建立，工龄重新计算，劳动合同重新签订，则应该与原来的公司在劳动关系上做一了断，主张自己的合法权益。包括解除合同、经济补偿等。工龄一事没关系。将来退休时，以社会保险交费和档案中劳动合同履行情况为准计算。
《劳动合同法》第三十四条用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。
