工伤认定公司赔偿员工的方式如下：
1.如用人单位依法为工伤职工缴纳了工伤保险，用人单位则需支付工伤职工停工留薪期工资、构成伤残的话五级六级伤残职工按月领取的伤残津贴，及职工离职时的一次性伤残就业补助金的项目。
2.如用人单位没有依法为工伤职工缴纳工伤保险费，则还应由用人单位承担工伤保险基金应支付给工伤职工的所有赔偿项目，即工伤医疗费和康复费、住院伙食补助费、统筹地区以外就医的交通食宿费、住院伙食补助费、伤残扶助器具费、生活护理费、一次性伤残补助金或伤残津贴及一次性医疗补助金。
申请工伤认定需要准备的材料为：
1.《工伤认定申请表》，工伤认定者可以向当地劳动保障部门申请；
3.医疗机构出具的受伤后的医疗诊断证明书或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）；
4.工伤职工的身份证。
找法网提醒您：办理申请认定时需要带齐相关证件，以确保流程顺利进行。
工伤认定申请提交后有结果的时间为六十天内。
我国法律明确规定，社会保险行政部门应当自受理工伤认定申请之日起六十日内作出工伤认定的决定。如果所受理的事实清楚、权利义务明确的工伤认定申请的，可在十五日内作出工伤认定书。
根据《工伤保险条例》第二十条第一、二款规定，社会保险行政部门应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定的决定，并书面通知申请工伤认定的职工或者其近亲属和该职工所在单位。
社会保险行政部门对受理的事实清楚、权利义务明确的工伤认定申请，应当在15日内作出工伤认定的决定。
