公司可以罚款扣工资，但是不能随便罚款。因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。找法网提醒您，经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。
1.罚款的主体是行政主体，并不是所有的组织和个人都有罚款的权力，也不是所有的行政主体都有罚款的权力，只有那些经过法律、法规或者规章授权的行政主体才有罚款的权力；
2.罚款的对象只能是行政管理相对人，特定的行政主体行使罚款的权力也不是没有限制的，其只能对行政管理相对人进行，任何组织都不能对其所属的成员进行罚款，具有罚款权力的特定行政主体也不例外；
3.罚款的原因只能是针对违反行政管理法规的行为。罚款的本质是一种行政处罚，这一性质决定了罚款只能是针对违反行政管理法规的行为。而对其他行为，即使是违法行为也不能进行罚款。
公司罚款员工不合理可以去以下部门投诉：
1.到劳动行政部门举报，劳动保障行政部门对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为的调查，应当自立案之日起60个工作日内完成，对情况复杂的，可以延长30个工作日；
2.也可以直接申请仲裁；
3.如果对仲裁结果不满意可以在拿到仲裁书后15天之内到法院起诉。
公司扣罚员工工资是否合法，要依据实际情况而定，以下几种情形，扣罚员工工资合法：
1.员工违反公司的制度，公司可以依照公司制度扣罚员工工资，但前提条件是公司制度合法。
2.员工在工作中造成公司严重损失，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
3.员工绩效不达标。绩效工资本身就被定义为浮动工资，公司可以通过绩效考核来达到增减员工绩效工资。因此如果员工绩效被判定为“不达标”，单位可以合法扣绩效工资。
