公司股东退出的办理方式是：
1.到之前开立股票账户的营业部(必须是之前开股票账户的券商营业部，即在哪里开的股票账户就必须在哪里注销股票账户，无法到其他券商办理，也无法在开股票账户的券商的其他营业部办理，)提出注销股票账户的申请。
2.按照券商营业部的要求在券商营业部给单子找该营业部的相关负责人签字。
3.在券商营业部各个岗位的相关负责人签完字之后到柜台凭身份证和股东账户卡办理股票账户的销户手续。
4.在办理股票账户的销户手续之后的第二天或者这之后办理证券资金账户的销户手续。
从股东退股所依据的意思表示来划分，股东退股可以划分为以下两类：
1.协商退出
这种退股是以股东共同意思表示为依据的退出。找法网提醒，根据共同意思的形成时间，又分两种情况，一种情况是在公司成立伊始订立的合同或者章程中事先规定好股东退股的情形。另一种情形是在公司运作的过程中，一方股东提出退股，其余股东表示同意的退出。
2.单方退股
单方退股是指股东不能、不愿或者不适合继续参加公司的经营，而退出公司的方式。
所谓公司股东退股，可以根据股东退股的方式不同分为以下两种情况：
第一种，股权转让；股东通过把持有的股权转让给公司其他股东或者股东以外的第三人，以实现退出公司，完成股东的退股。这种方式实际是进行股权的买卖，其中转让给其他股东的，可以由双方直接签订协议；转让给第三人的，需要其他股东过半数同意后才能转让，并且股东对股权转让享有优先购买权。以股权转让的方式退股，并不发生公司清算行为，股权价格可以依据目前所持有的股权价值决定。
第二种，公司不打算继续经营的，经股东会决定解散，这个时候就需要通过股东会决议，实施公司的清算。清算流程：成立清算组——开始清算工作——提出清算的方案——进行公司资产分配——结束清算。清算之后，就可以办理公司解散，以及到工商，税务办理注销业务了。
