撤销指定监护人，所代管的遗产的处理方式是：应当交付给重新指定的监护人。
《民法典》第三十六条 【撤销监护人资格】监护人有下列情形之一的，人民法院根据有关个人或者组织的申请，撤销其监护人资格，安排必要的临时监护措施，并按照最有利于被监护人的原则依法指定监护人：
(一)实施严重损害被监护人身心健康的行为;
(二)怠于履行监护职责，或者无法履行监护职责且拒绝将监护职责部分或者全部委托给他人，导致被监护人处于危困状态;
(三)实施严重侵害被监护人合法权益的其他行为。
本条规定的有关个人、组织包括：其他依法具有监护资格的人，居民委员会、村民委员会、学校、医疗机构、妇女联合会、残疾人联合会、未成年人保护组织、依法设立的老年人组织、民政部门等。
在我国以被监护人为中心原则指定监护人。
不管是法定监护还是指定监护，都是以被监护人为中心，因此有关组织为没有或者限制民事行为能力人在其近亲属中指定监护人虽然不受顺序的限制，但都必须遵守以被监护人为中心的原则。
《民法典》第三十一条第二款规定，居民委员会、村民委员会、民政部门或者人民法院应当尊重被监护人的真实意愿，按照最有利于被监护人的原则在依法具有监护资格的人中指定监护人。
找法网提醒您，居委会能指定监护人的。根据相关法律规定，当事人对监护人的确定有争议的，由被监护人住所地的居民委员会、村民委员会或者民政部门指定监护人。有关当事人对指定不服的，可以向人民法院申请指定监护人。
