重大环境污染事故罪立案标准是：
1.违反国家规定，向土地、水体、大气排放、倾倒或者处置有放射性的废物、含传染病原体的废物、有毒物质或者其他危险废物，造成重大环境污染事故，致使公私财产遭受重大损失或者人身伤亡的严重后果的。
2.向环境中排放、倾倒或者处置危险废物的行为。具体指向土地、水体、大气排放、倾倒或者处置有放射性的废物、含传染病原体的废物、有毒物质或者其他危险废物。
3.向土地、水体、大气排放、倾倒或者处置放射性的废物、含传染病原体的废物、有毒物质或者其他危险废物，给环境造成巨大的恶劣影响，致使多人发生明显中毒症状、辐射伤害或者可能导致伤残后果，或者对环境造成较大危害，使公私财产遭受重大损失的情形。
环境污染处罚流程：
1.执法人员应向当事人出示中国环境监察证或者其他行政执法证件；
2.现场查清当事人的违法事实，并依法取证；
3.向当事人说明违法的事实、行政处罚的理由和依据、拟给予的行政处罚，告知陈述、申辩权利；
4.听取当事人的陈述和申辩；
5.填写预定格式、编有号码、盖有环境保护主管部门印章的行政处罚决定书，由执法人员签名或者盖章，并将行政处罚决定书当场交付当事人；
6.告知当事人如对当场作出的行政处罚决定不服，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼。
找法网提醒您，污染环境罪的处罚标准为：犯此罪的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；情节严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金；情节特别严重的，处七年以上有期徒刑，并处罚金。
