商铺房屋契税计算方式是：应纳税额＝计税依据×税率，计税依据多为房屋买卖的成交价格为依据。
一般情况下，在你收房90天内，凭购房合同、发票、身份证、户口本、婚姻情况证明，到房管，咨询办理缴纳契税，住房维修基金和手续费，印花税，然后办理房产证。若逾期，便按照每天万分之五来计算滞纳罚金。契税的征税对象是境内转移的土地，房屋权属。
找法网提醒您，房产交易时过户契税一般由买方缴纳，契税的纳税义务发生时间，为纳税人签订土地、房屋权属转移合同的当天，或者纳税人取得其他具有土地、房屋权属转移合同性质凭证的当天。除非当事人另有约定，一般而言契税由买方交，如果房产证由开发商代办，就由买方交给开发商，由开发商再转交给产权产籍管理中心。
契税具体的征收如下：
1.根据规定，个人购买普通住房，且该住房为家庭唯一住房的，所购普通商品住宅户型面积在90平方米（含90平方米）以下的，契税按照1%执行；
2.户型面积在90平方米到144平方米（含144平方米）的，税率减半征收，即实际税率为2%；所购住宅户型面积在144平方米以上的，契税税率按照4%征收；
3.对个人购买家庭第二套改善性住房，面积为90平方米及以下的，减按1%的税率征收契税；面积为90平方米以上的，减按2%的税率征收契税。
4.购买非普通住房、二套及以上住房，以及商业投资性房产（商铺、办公写字楼、商务公寓等），均按照4%的税率征税。
