辞职后保密协议补偿不补偿，依法起诉。因用人单位的原因导致三个月未支付经济补偿，劳动者可以请求解除竞业限制约定。
保密协议补偿这个属于竞业限制补偿金。依法应当离职后由用人单位按月收入的30％或当地最低工资标准的30％按月发放。竞业限制的期限最长不得超过2年，竞业限制补偿金也要发放2年。如果用人单位拒不发放，劳动者可以依法提起劳动仲裁要求用人单位发放。特别指出的是，用人单位不支付竞业限制补偿金。劳动者也不能违反竞业限制。因为一个协议的效力不能因为履行的不同而一会儿有效或一会儿无效。既然用人单位违反竞业限制拒不支付竞业限制补偿金，劳动者可以请求用人单位支付，那么协议就是有效的。
签订保密协议有以下作用：
1.企业与雇员签订保密协议，可以提高员工保密意识，起到教育员工自觉遵守公司保密规定，履行自己对公司商业秘密保护的责任和义务的作用。
2.企业通过保密协议，明确向雇员告知本企业存在商业秘密的事实、商业秘密范围、以及雇员对商业秘密必须承担的权利和义务。
3.让雇员清楚的知道违反保密协议规定、非法侵犯企业商业秘密应承担的法律后果和赔偿责任，约束雇员的行为，强化了公司商业秘密的保护力度。
保密协议没有保密费仍然有效。找法网提醒，对企业或他人的商业秘密承担保密义务是员工或任何人的法定义务，有没有支付保密费均不影响保密义务的承担。商业秘密是指不为公众知悉，能为权利人带来经济利益，具有实用性并经权利人采取保密措施的技术信息和经营信息。
