克扣工资，员工有以下方式讨薪：
1.协商解决。劳动者与用人单位就劳动纠纷问题直接进行协商，这不是必经程序，双方可以协商，也可以不协商，完全出于自愿。
2.申请调解。调解程序也由当事人自愿选择，调解协议不具有强制执行力，如果一方反悔，同样可以向仲裁机构申请仲裁。
3.仲裁处理。当事人将纠纷提交劳动争议仲裁委员会进行处理的程序，如果想提起诉讼打劳动官司，必须经过仲裁程序，不能直接向人民法院起诉。
4.诉讼解决。诉讼程序的启动是由不服劳动争议仲裁委员会裁决的一方当事人向人民法院提起诉讼后启动的程序。
找法网提醒您，企业克扣工资的后果有：
1.用人单位依法要承担民事责任：用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，以及拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的，劳动者可以随时通知用人单位解除劳动合同并要求用人单位赔偿。
2.用人的单位无故拖欠职工工资，劳动者可以举报到劳动行政部门，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
企业以下情况减发工资不属“克扣工资”：
1. 国家的法律、法规中有明确规定的；
2.依法签订的劳动合同中有明确规定的；
3. 用人单位依法制定并经职代会批准的厂规、厂纪中有明确规定的；
4.企业工资总额与经济效益相联系，经济效益下浮时，工资必须下浮的；
5. 因劳动者请事假等相应减发工资等。
