公安机关申请强制执行的费用由被执行人承担。
《公安机关办理行政案件程序规定》第二百零六条 当事人在法定期限内不申请行政复议或者提起行政诉讼，又不履行行政处理决定的，法律没有规定公安机关强制执行的，作出行政处理决定的公安机关可以自期限届满之日起三个月内，向所在地有管辖权的人民法院申请强制执行。因情况紧急，为保障公共安全，公安机关可以申请人民法院立即执行。强制执行的费用由被执行人承担。
申请强制执行的程序是：
1.提出申请，申请强制执行必须符合以下条件：一是必须有生效的行政裁判文书作为执行的依据。二是裁判文书必须具有可执行的内容，即要求裁判文书须具有能通过积极作为完成的内容。
2.法院受理，当事人、利害关系人认为执行行为违反法律规定的，可以向负责执行的人民法院提出书面异议。
3.申请复议(对强制执行裁定有异议)，当事人、利害关系人对裁定不服的，可以自裁定送达之日起10日内向上一级人民法院申请复议。
4.发出执行通知，执行员接到申请执行书或者移交执行书，应当向被执行人发出执行通知，责令其在指定的期间履行，逾期不履行的，强制执行。
5.采取强制措施，执行完毕后，应当将执行情况制作笔录，由在场的有关人员签。名或者盖章。
找法网提醒您，强制执行方式具体如下：
1.查询、冻结、划拨。
2.扣留、提取被申请执行人的收入。
3.查封、扣押、拍卖、变卖被申请执行人的财产。
