商标侵权赔偿一般赔偿方式是按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定，实际损失难以确定的，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定，权利人的损失或者侵权人获得的利益难以确定的，参照该商标许可使用费的倍数合理确定。对恶意侵犯商标专用权，情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的一倍以上三倍以下确定赔偿数额。赔偿数额应当包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。
商标侵权法定赔偿的诉讼时效是2年，自商标注册人或者利害权利人知道或者应当知道侵权行为之日起计算。应当严格适用民法通则的规定，既然商标权人明明知道有人侵权却又置时效于不顾，不及时采取措施，自然应当承担不受保护的结果。对于连续实施的知识产权侵权行为，从权利人知道或应该知道之日起至权利人向人民法院提起诉讼之日止已超过两年的，人民法院不简单地以超过诉讼时效为由判决驳回权利人的诉讼请求。在该项知识产权受法律保护期间，人民法院应当判决被告停止侵权行为，找法网提醒您，侵权损害赔偿额应自权利人向人民法院起诉之日起向前推算两年计算，超过两年的侵权损害不予保护。
商标侵权赔偿有三种计算方式：
1.侵权人因侵权获得的利益。
2.被侵权人因为侵权而受到的损失。
3.法定赔偿。
根据《最高人民法院关于审理商标民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》第十三条规定：“人民法院依据商标法第五十六条第一款的规定确定侵权人的赔偿责任时，可以根据权利人选择的计算方法计算赔偿数额。”这就是说被侵权人可以自行选择是适用第一种计算方式还是第二种计算方式，如果这两种方式都无法计算，那么由法院直接适用第三种方式。
