公司股权转让协议生效的标志是工商登记。除非股权转让合同另有约定，否则股权转让合同一经签订即生效，但完成股权转让尚需股东会决议、股东名册记载、工商变更登记等程序，并以工商登记确认为完成的标志。找法网提醒您签订股权转让协议时未征求全体股东意见，协议存在瑕疵。
股权转让协议注意事项有：
1.明晰股权结构，应就被转让公司的股权结构作详尽了解。
2.资产评估，明晰股权结构，确认转让的份额后，应请国家认可的资产评估所对被收购公司的资产及权益进行评估，出具评估报告，并将评估结果报国家有关资产评审机构批准确认。
3.确定股权转让总价款，股权转让合同各方共同约定股权转让总价款。
4.出让方的保证。
5.股权转让合同受让方保证。
6.确定转让条件，股权转让合同各方协商一致，确定转让的条件。
7.确定股权转让的数量（股比）及交割日。
8.确定股权转让的价值。
9.设定付款方式与时间。
10.确定因涉及股权转让过程中产生的税费及其他费用的承担。
股权转让协议应包括如下主要内容：
1.转让标的、转让价格、付款方式及付款期限；
2.转让方的告知义务或瑕疵担保义务；
3.股权转让的交割期限及方式，股东相关权利及义务让渡发生法律效力的时间；
4.股权转让变更登记约定或实际交接手续约定；
5.股权转让前后公司债权债务约定；
6.违约责任；
7.争议解决方式。
