植物新品种权申请程序要按以下步骤走：
1.育种者应提交相应的申请文件。
2.文件准备齐全后，申请林业植物新品种权的申请人，可以直接向国家林业局提出申请，也可委托国家林业局指定的代理机构代理申请。对于申请品种权的育种者，可以直接向国家林业局植物新品种保护办公室递交申请文件，也可通过邮局邮寄申请文件。
3.申请文件递交后，申请人所申请的保护品种将在国家林业局下发的书面公告或网上进行公告，如果在公告期没有任何人对该品种提出质疑，该申请人将获得新品种保护权。
找法网提示：植物新品种保护的期限依培育植物品种所需的时间长短而定。一般地说，木本植物培育的时间较长，因此保护的期限也较长。我国规定：藤本植物、林木、果树和观赏树木的品种权保护期限为20年，其他植物为15年。
植物新品种权申请费是1000元。
每种植物新品种的保护权申请费1000元。每个品种的考试费2500元，在保护期内，第一年至第六年年费为1000元，其后年费为1200元。
但是，为了进一步规范管理和维护权益，按照合理、合法、公平、公正的原则，按照财政部国家发展和改革委员会《关于清理和规范有关政策的通知》的要求，申请费、审查费和保护新植物品种权的年费将从2017年4月1日起暂停。
申请植物新品种权的条件是：
1.申请品种权的植物新品种应当属于国家植物品种保护名录中列举的植物的属或者种。
2.授予品种权的植物新品种应具有新颖性。
3.授予品种权的植物新品种应当具备一致性。
4.授予品种权的植物新品种应当具备稳定性。
5.授予品种权的植物新品种应当具备适当的名称，并与相同或者相近的植物属或者种中已知品种的名称相区别。
