农村房屋变更户主需要的手续费依据房屋面积大小的不同而不同，具体包括以下几种收费内容：
1.税类：
（1）契税按产价百分之二;
（2）印花税按产价万分之五。
2.费类：
（1）登记费80.00元;
（2）交易手续费百分之二(按产价);
（3）工本费20.00元。
农村房屋变更户主需提交材料有：
1.户口簿原件、复印件、身份证复印件一份(A4纸)
2.当地公安局派出所的证明
3.申请书一份、委托书一份
4.宅基地使用权登记表
5.原土地登记卡二件，原宅基地使用证原件6、更正后填写的土地登记卡三张。
找法网提醒：办理过户登记时需要带齐相关手续材料，以确保流程顺利进行。
有下列情形之一的，公民可以申请变更户主，由派出所户籍内勤民警直接办理：
1.原户主死亡、被宣告死亡或者被宣告失踪的。所需材料：
（1）直系亲属提出书面申请报告；
（2）死亡证明；
（3）法院死亡或失踪判决。
2.户主户口迁出的。所需材料：
（1）户内成员提出书面申请报告
（2）原户主迁出凭证 。
3.房屋所有权或者使用权发生转移，现房屋所有权人或者使用人认为需要变更的。所需材料：
（1）现房屋所有权人或使用人提出书面申请报告；
（2）《房产证》或有效凭证。
4.其他原因应当变更户主的。所需材料：
（1）原户主提出书面申请报告；
（2）其它相关材料。
房产证想要变更户主是在法律允许范围之内的。我国的不动产实行的是登记生效制度。物权的变动必须要进行登记公示才具有法律效力。因此，如果当事人想要变更户主，新的户主想要拥有房屋的所有权，那么就必须要房产证来进行证明。
