农村违建房归县级以上人民政府土地行政主管部门（国土资源局）、乡、镇人民政府管理。这是根据以下两条规定得出的结论：
1.据《北京市禁止违法建设若干规定》第十五条，乡镇人民政府发现正在建设的乡村违法建设后，应当立即书面责令停止建设，当事人不停止建设的，可以查封施工现场。
2.据《城乡规划法》第六十五条，在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照乡村建设规划许可证的规定进行建设的，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。
违法违建可以到主管部门的城管局进行投诉的，但是需要搜集相关的证据，若不能得到重视，才采用网络媒体，也可以向中纪委网站直接举报。市民如果发现违建，可以拨打12319城建服务热线举报。在收到举报后，属地城管部门在1~2天内就能查处有没有违建，慢也就3~4天。城管部门对违建的办案周期一般为45天。不过，接下来还需要把对违建的处理调查方案报知多个部门，并且征求规划部门的意见，才能进行拆除等事宜。未经规划、国土资源、城市管理部门审批的建筑物、构筑物，均属违章建筑，违反了《规划法》、《城市管理条例》等法律、法规、规章。
农村违建房拆除有赔偿。农村违建房没有统一的拆迁补偿标准，由各地各自制定拆迁安置补偿政策。各地的补偿流程、标准不尽相同，找法网提醒您，有一个相通的基本的原则即农村违建房拆除有赔偿，违章建筑不予补偿。
