职务侵占案属于刑事案件，和其它刑事案件立案程序是一样的。公安机关接受案件后，经审查，认为有犯罪事实需要追究刑事责任，且属于自己管辖的，经县级以上公安机关负责人批准，予以立案;认为没有犯罪事实，或者犯罪事实显著轻微不需要追究刑事责任，或者具有其他依法不追究刑事责任情形的，经县级以上公安机关负责人批准，不予立案。对有控告人的案件，决定不予立案的，公安机关应当制作不予立案通知书，并在三日以内送达控告人。刑法还规定，人民检察院认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查的，或者被害人认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查，向人民检察院提出的，人民检察院应当要求公安机关说明不立案的理由。人民检察院认为公安机关不立案理由不能成立的，应当通知公安机关立案，公安机关接到通知后应当立案。
刑法第271条规定，“公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处5年以下有期徒刑或者拘役：数额巨大的，处5年以上有期徒刑，可以并处没收财产。”根据最高人民法院《关于常见犯罪的量刑指导意见》规定，构成职务侵占罪的，可以根据下列不同情形在相应的幅度内确定量刑起点：
（一）达到数额较大起点的，可以在二年以下有期徒刑、拘役幅度内确定量刑起点。
（二）达到数额巨大起点的，可以在五年至六年有期徒刑幅度内确定量刑起点。各省、自治区、直辖市公安厅、局应当会同当人民检察院，结合本地实际情况，确定本省、自治区、直辖市范围内统一执行的数额标准，并上报备案。
职务侵占构成犯罪的，被侵占单位可以到公安机关报案，如果有犯罪事实的，公安机关是会立案的。
第十四条 根据刑事诉讼法的规定，刑事案件由公安机关管辖，但下列刑事案件除外：
（一）贪污贿赂犯罪，国家工作人员的渎职犯罪，国家机关工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、报复陷害、非法搜查的侵犯公民人身权利的犯罪以及侵犯公民民主权利的犯罪案件，经省级以上人民检察院决定立案侦查的国家机关工作人员利用职权实施的其他重大的犯罪案件;
（二）自诉案件，但对人民法院直接受理的被害人有证据证明的轻微刑事案件，因证据不足驳回起诉，人民法院移送公安机关或者被害人向公安机关控告的，公安机关应当受理;被害人直接向公安机关控告的，公安机关应当受理;
（三）军人违反职责的犯罪和军队内部发生的刑事案件;
（四）罪犯在监狱内犯罪的刑事案件;
（五）其他依照法律和规定应当由其他机关管辖的刑事案件。
第一百七十五条 公安机关接受案件后，经审查，认为有犯罪事实需要追究刑事责任，且属于自己管辖的，经县级以上公安机关负责人批准，予以立案;认为没有犯罪事实，或者犯罪事实显著轻微不需要追究刑事责任，或者具有其他依法不追究刑事责任情形的，经县级以上公安机关负责人批准，不予立案。
对有控告人的案件，决定不予立案的，公安机关应当制作不予立案通知书，并在三日以内送达控告人。
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