（一）结果不同。
权利人超过保证期间诉请权利的，法律对于权利人的实体权利不予保护，即，义务人因权利人怠于行使权力而免责，债权债务关系终止。而权利人如果在诉讼时效期间怠于行使权力的，权利人的实体权利并不丧失，其丧失的为胜诉权，即权利人的诉讼利益将无法获得法律保护，超过诉讼时效期间，当事人自愿履行债务的，不受诉讼时效限制，从此法律规定可以也可以看出，权利人超过诉讼时效诉请权利的，其实体权利依然存在。
（二）保证期间具有约定性和法定性，诉讼时效是法定的，不可以约定。
根据我国法律规定，保证期间原则上是约定期间，可以由当事人自有协商确定，在当事人没有约定或者约定不明或约定无效时，适用法定的保证期间。而诉讼时效为法律的强制性规定，根据《最高人民法院关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定》第2条、第3条规定，当事人违反法律规定，约定延长或者缩短诉讼时效期间、预先放弃诉讼时效利益的，人民法院不予支持的规定，当事人不能预先排除或妨碍诉讼时效的适用，否则其约定无效。
（三）保证期限是不变期间，诉讼时效是可变期间。
保证期间为除斥期间，根据除斥期间理论，除斥期间为不变期间，权利人超过除斥期间怠于行使权力将使权利义务归于消灭，设立除斥期间的目的是为了督促权利人及时行使权利，使权利义务的不特定性归于确定，同时保障法律关系的稳定。诉讼时效与保证期间有别，诉讼时效可以因特定事由中止、中断、延长。
由于保证期间上述特性，要求权利人必须在一定期限内行使权利，这无疑加大了权利人的责任，在实务中，往往有权利人因对法律不了解而丧失保证权利的案件发生，因此，为了维护权利人的合法权益，不因由于超过保证期间行使权利而蒙受重大损失，权利人必须与保证人就保证期间达成约定，且约定必须明确。
保证的诉讼时效为三年。诉讼时效期间是可变期间，是指权利人在法定期间内不行使权利，持续达到一定期间而致使其请求权消灭的法律事实。诉讼时效期间从债权人知道或应当知道权利被侵害时起算，适用诉讼时效中止、中断、延长的规定。诉讼时效期间届满，权利人丧失胜诉权。
（一）一般保证中的债权人在保证期间届满前对债务人提起诉讼或申请仲裁的，从判决或者仲裁裁决生效之日起，开始计算保证合同的诉讼时效。如果债权人没有对债务人提起起诉或仲裁的，即为保证期间经过，保证人免责。
（二）连带保证中的债权人在保证期间届满前请求保证人承担保证责任的（诉及诉讼外的权利请求都可以，但要针对保证人本人），保证合同诉讼时效开始计算，如果债权人未请求保证人承担保证责任的，即为保证期间经过，保证人免责。这里并不需要债权人向债务人提起诉讼或申请仲裁，所以连带保证的诉讼时效期间起算日与一般保证不同。
可以，一般保证中，主债务诉讼时效中断，保证债务诉讼时效中断;连带责任保证中，主债务诉讼时效中断，保证债务诉讼时效不中断。”从字面意思上理解，有人认为，在连带责任保证中，保证债务诉讼时效不会中断，即任何情况下都不发生中断，也即诉讼时效只有三年，超过三年即为超过连带责任保证合同诉讼时效。事实上，这种理解断章取义，不符合法律条文的正确理解方法。该条文着眼于一般保证与连带保证的区别，及在主债务诉讼时效中断的情况下，对于一般保证与连带保证所产生的不同法律后果和影响。因为连带责任保证与一般保证的最根本区别在于，连带责任保证人责任和义务较重，对债权人不享有先诉抗辩权;连带责任保证债务的诉讼时效不因主债务诉讼时效的中断而中断。假如债权人仅向债务人主张了权利，则引起主债务诉讼时效中断，并不必然引起连带责任保证债务诉讼时效的中断。
连带责任保证债务的诉讼时效应当适用普通诉讼时效的规定。既然定位于诉讼时效，就应当适用民法所规定的普通诉讼时效关于中断、中止、延长的规定。如果债权人在诉讼时效内同时向债务人及连带责任保证人主张了权利，那么主债务与连带责任保证债务是诉讼时效同时发生中断。
以上就是由找法网编辑整理收集的关于保证合同的诉讼时效和保证期间的区别的法律知识。在保证期间和诉讼时效期间内债权人没有行使权利，都可能导致保证人不再承担保证责任的法律后果。但两者有着本质的区别，保证期间内，债权人行使权利，既变更了原有的法律关系，使保证期间的作用消灭；在诉讼时效期间内，权利人行使了权利，在于维持原有的法律关系，使原有的法律关系得以继续存续。如果您还有其他问题的，欢迎咨询找法网律师。
