企业三证合一后还需要去税务局办理以下流程：
（一）纳税人作废手中全部发票，并保持开票系统联网且数据上传成功;
（二）次日，纳税人登陆“网上办税服务厅”查询发票结存数量，确保所有发票结存为零。如无法实现自动验旧，纳税人需到办税服务厅手工验旧;
（三）纳税人持税控设备，到办税服务厅纳税申报窗口进行非征期报税;
（四）纳税人持税控设备，到办税服务厅金税注销窗口注销税控设备;
（五）纳税人到办税服务厅税务登记窗口办理三证合一变更手续;
（六）纳税人到一般纳税人资格登记岗办理金税档案维护;
（七）纳税人持税控设备，到办税服务厅金税发行窗口重新发行设备;
（八）纳税人持税控设备、购票人身份证到办税服务厅发票售卖窗口申领新发票。
（九）银行信息变更，重新签署“税银联网三方协议”
开设银行账户时按规定要登记税务登记证号，号码升位后，要到开户银行申请终止“税银联网三方协议，然后办理税号变更，再重新签署新的“税银联网三方协议”，否则将无法完成扣税操作。纳税人在多个银行开设多个银行账户，请分别办理。切勿因此造成迟缴税款，被加收税务滞纳金。
三证合一后去税务局登记需要带什么资料?
工商部门的营业执照（三证合一即营业执照，税务登记证，企业组织结构代码进行合并）
（一）企业需要提供工商营业执照、组织机构代码证和税务登记证的原件、一份表格（办理机构就有的）
（二）需要企业法人身份证复印件（代办的需要代办人的身份证原件及复印件）
（三）需要企业的公章
（四）提交到行政务服务中心综合窗口，5-6个工作日后，可领取“三证合一”后的营业执照。
国家税务局（国税局）：
（一）营业执照（原件 复印件加盖公章）
（二）公章
（三）经办人身份证复印件
（四）法人身份证复印件
（五）金税盘
（六）发票领购簿
（七）法人印章 财务印章（可能会用到）
（八）到国税局取号填单子（会用到法人印章等）
以上资料办理税务的三证合一，然后办理
（九）到地税局做一个税务登记
三证合一整体的情况：
（一）首先，存数据，清盘;
（二）然后办理税号更改;
（三）最后，老发票进行全部的发票认证;到银行办理税务代扣，最后把回执单送回国税（三方）
是否要更换发票专用
（一）新设立的企业，用统一社会信用代码刻制发票专用章。具体式样和尺寸规定参照《国家税务总局关于发票专用章式样有关问题的公告》（国税总局公告2011年第7号）。
（二）纳入“三证合一”范围的存量企业因工商登记信息变更换发载有18位统一社会信用代码营业执照的，其纳税人识别号应同时变更。
但在当前技术条件下，企业识别号变更会带来CA数字证书的换发、三方协议的变更、防伪税控系统的重新发行等一系列后续工作。如企业目前暂不需要做税号变更，可暂不刻换发票专用章，待技术问题进一步解决后再变更税号并且刻换发票专用章。
如何开具发票
（一）给新设立的企业开票，一般情况下按照18位信用代码作为纳税人识别号开具发票
特别提醒：个别地方对新设立的企业开票，虽已取得新的三证合一（18位信用代码），也按照一定的规律从18位信用代码取15位纳税人识别号，那就需要把按规律取得15位纳税人识别号作为纳税人识别号开具发票
如：厦门自贸区内新办企业三证合一的18位注册号去掉开头的2位数和最后的1位数，剩下的15位就是税务登记证号码。
（二）给纳入“三证合一”范围的存量企业，若企业当地暂不需要做税号变更，按照原15位纳税人识别号开具发票;若企业当地已将18位信用代码作为纳税人识别号，按照18位信用代码作为纳税人识别号开具发票;
（三）“三证合一”之后，企业通过税控器具应当能够为已取得18位信用代码的客户开具发票。如果无法开具，企业应立即与税控设备服务商联系，尽快进行系统升级。
已领取组织机构代码的纳税人税务登记代码为：区域码+国家技术监督部门设定的组织机构代码。纳税人识别号，一律由15位、18或者20位码（字符型）组成，其中：企业、事业单位等组织机构纳税人，以国家质量监督检验检疫总局编制的9位码（其中区分主码位与校验位之间的“-”符省略不打印）并在其前面加挂6位行政区划码共15位码，作为其“纳税人识别号”。国家税务总局下达的纳税人代码为15位，其中：1—2位为省、市代码，3—6位为地区代码，7—8位为经济性质代码，9—10位行业代码，11—15位为各地自设的顺序码。从事生产、经营的外籍、港、澳、台人员税务登记代码为：区域码+相应的有效证件（如护照，香港、澳门、台湾居民往来大陆通行证等）号码。个体工商户税务登记代码为其居民身份证号码。个体工商户和其他缴纳个人所得税的中国公民，以公安部编制的居民身份证18位码为其“纳税人识别号”;对外国人以其国别加护照号码作为其“纳税人识别号”。注意事项：18位纳税人识别号编码规定：凡是与数字混淆的字母，一律不列入编码（编码中不使用这些字母），这些抛弃的字母是iozsv，所以开票时应注意。
以上就是找法网小编为您详细介绍关于三证合一后税务登记办理流程的相关知识，通过上文可知，三证合一实施以后原来的工商营业执照、税务登记、组织机构代码证等都需要到有关机构办理变更手续。如果您还有其他的法律问题，欢迎咨询找法网，我们会有专业的律师为您解答疑惑。
