三方协议有法律效力的。
对个人来说，签了三方协议，持报到证到就业单位签署劳动合同后，开始计算工龄，就业单位可以给个人缴纳各项保险，并在就业单位当地落户。就接收单位而言，企业与个人签订三方协议，也就意味着可以接收毕业生档案，并保障学生的上述权利。
三方协议一旦签订之后任何一方不得擅自解除，否则违约方应向权利受损方支付协议条款所规定的违约金，从实际情况来看，违约方多是毕业生。一旦违约，除本人应承担违约责任，还要支付违约金，因此毕业生需谨慎。
一般来说，一位毕业生只有一份三方协议，如果签订后违约必须与原单位协商后要回协议，退还学校换取新的协议。如果不能换回新的三方协议重新签订，将可能影响毕业派遣，对自身最终就业产生影响。
三方就业协议书不同于劳动合同。首先，三方就业协议书是国家教育部统一印制的，主要是明确三方的基本情况及要求。三方就业协议书制定的依据是国家关于高校毕业生就业的法规和规定，有效期为：自签约日起至毕业生到用人单位报到止的这一段时间。而劳动合同是受《劳动法》和《民法典》的限定和保护，有些用人单位如许多外企在确定录用时（注：在到用人单位报到前），就同时要求和毕业生签订一份类似劳动合同的协议;而更多的用人单位则要求先签“就业意向书”，毕业生报到后再签订劳动合同。其次，就业协议是三方合同，它涉及学校、用人单位、学生等三方面，三方相互关联但彼此独立;而劳动合同是双方合同，它由劳动者和用人单位两方的权利、义务构成。第三，毕业生签订就业协议时仍然是学生身份，但是签订劳动合同时应当是劳动者身份。劳动合同一经签订，就业协议的效力应当丧失。若劳动合同与三方协议附件内容矛盾，则以劳动合同为准。
（一）实际中，签订三方协议时，一般会说好违约情形，并说明违约金的数额。所以，签订三方协议后毁约的，是否需要支付违约金，得看协议书内容。
并且，根据三方协议的约定会按以下处理：
1、如果协议中约定了违约金，那么谁毁约谁就应该支付违约金，但是违约金过高的可以要求减少。
2、如果协议中没有相关违约金的规定，便不需要支付违约金。
因此，不想去协议约定的岗位，在毁约之后是否支付违约金，需要按照协议书约定处理。
（二）另外，签订三方协议时将直接涉及切身利益，所以在签约时要注意以下：
1、大学生签三方协议首先要看填写的用人单位名称是否与单位的有效印鉴名称一致，如不一致，协议无效。在填写自己的专业名称时，要与学校教务处的专业名称一致，不能简写。
2、外企、合资企业、私企一般采用试用期，根据合同期的长度，可以从1-3个月不等，通常试用期为3个月，不得超过6个月。国家机关、高校、研究所一般采用见习期，通常为一年。
3、约定违约金时不宜过高，学生在协商中要力争将违约金降到最低，通常违约金不得超过5000元。
4、毕业生就业协议属“格式合同”，毕业生可将签约前达成的休假、住房、保险等福利待遇在备注栏中说明，如发生纠纷可以拿这个维护合法权利。
5、学生在签订协议时，要严格按照规定的步骤进行。
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