土地被征收后，青苗补偿费归青苗所有者所有。依据《土地管理法实施条例》第26条规定，土地补偿费归农村集体经济组织所有；地上附着物及青苗补偿费归地上附着物及青苗的所有者所有。可理解为归实际种植者即实际承包者所有。如果被他人领取，可通过诉讼要求返还。
青苗费的赔偿标准每个地区都是不一样的，是由各个省、自治区、直辖市自己制定的。不过在征地之前，政府都会进行公告的。一般而言青苗补偿标准:对刚刚播种的农作物，按季产值的三分之一补偿工本费。对于成长期的农作物，最高按一季度产值补偿。对于粮食、油料和蔬菜青苗，能得到收获的，不予补偿。对于多年生的经济林木，要尽量移植，由用地单位付给移植费；如不能移植必须砍伐的，由用地单位按实际价值补偿。对于成材树木，由树木所有者自行砍伐，不予补偿。其他附着物的补偿标准:征收土地需要迁移铁路、公路、高压电线、通讯线、广播线等，要根据具体情况和有关部门进行协商，编制投资概算，列入初步设计概算报批。拆迁农田水利设施及其它配套建筑物、水井、人工鱼塘、养殖场、坟墓、厕所、猪圈等的补偿，参照有关标准，付给迁移费或补偿费。
（一）纳税人将土地使用权归还给土地所有者时，只要出具县级（含）以上地方人民政府收回土地使用权的正式文件，无论支付征地补偿费的资金来源是否为政府财政资金，该行为均属于土地使用者将土地使用权归还给土地所有者的行为，按照《国家税务总局关于印发〈营业税税目注释（试行稿）〉的通知》（国税发〔1993〕149号）规定，不征收营业税。根据《土地管理法》规定，征用土地的补偿费用包括土地补偿费、安置补助费、地上附着物和青苗补偿费。由此可见，青苗补偿费不征收营业税。
（二）对土地承包人取得的土地上的建筑物、构筑物、青苗等土地附着物的补偿费收入，依照新法优于旧法的原则，只要出具县级（含）以上地方人民政府收回土地使用权的正式文件，青苗补偿费不属于按照国税函发〔1997〕87号文件规定应该征收营业税的情形，而按照国税函〔2008〕277号文件规定属于不征收营业税的情形，则对土地承包人取得的青苗补偿费收入暂免征收个人所得税。
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