根据退税的情况不一样，办理退税的时间不一样：
（一）纳税人已按预售面积、预售房款缴纳契税，但办理房产证时，发现实测面积与预售面积有误差，导致房款发生变化，致使纳税人多缴税款的，可以申请退税。
这种情况依据的是税收征管法第五十一条：纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还；纳税人自缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴纳的税款。
（二）房屋交易不成立，买卖双方撤销原房屋销售合同，并签订有退房协议，在办理房产证之前可以申请退还已缴纳契税。
此种情况依据的是财政部、国家税务总局印发的《关于购房人办理退房有关契税问题的通知》：对已缴纳契税的购房单位和个人，在未办理房屋权属变更登记前退房的，退还已缴纳契税；在办理房屋权属变更登记后退房的，不予退还已缴纳契税。
房契税又叫房产契税，契税是指以所有权发生转移变动的不动产为征税对象，向产权承受人征收的一种财产税。应缴税范围包括：土地使用权出售、赠与和交换，房屋买卖，房屋赠与，房屋交换等。首套房是指买房者购房时所拥有的第一套房产，在我国对于首套房是要给予一定的贷款优惠和契税优惠的，首套房契税减半征收、房地产契税下调。
对个人购买家庭唯一住房（家庭成员范围包括购房人、配偶以及未成年子女，下同），面积为90平方米及以下的，减按1%的税率征收契税；面积为90平方米以上的，减按1.5%的税率征收契税。对个人购买家庭第二套改善性住房，面积为90平方米及以下的，减按1%的税率征收契税；面积为90平方米以上的，减按2%的税率征收契税。
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