（一）提供实体和程序两类证据
人民法院对处罚行政案件的审查主要是合法性审查。被诉行政处罚决定的合法性有两大内容，即处罚实体内容合法和处罚操作程序合法。为了证明这两大类内容合法，行政执法机关应当向人民法院提供被处罚人实施违法行为的事实证据材料和作出行政处罚决定的程序证据材料，以证明行政处罚决定在实体上和程序上都是合法的。
在实践中，原告在行政诉讼中即使没有提出行政处罚程序问题，人民法院也要审查处罚程序是否合法，如果发现程序严重违法，在原告没有提出程序问题的情况下，也应当撤销行政处罚决定。因此，行政执法机关在应诉时必须提供处罚程序合法的证据材料。
（二）提供据以处罚的证据材料
行政诉讼只要求提供证据材料和法律依据，而没有要求提供整个案卷材料。除非人民法院因特别需要而要求予以调阅案卷外，被告行政执法机关只需提供证据材料和法律依据，不需提供其他材料，如调查报告、合议笔录等。行政执法机关在举证时，也不一定将所有证据材料都提供给人民法院，只要提供“据以处罚”的证据材料即可。只有经过审查被采用的、作为支持行政处罚决定的证据才是“据以处罚”的证据。当然，有些证据材料虽未采用，但对维持行政处罚决定有利的，也可以提供，为胜诉提供有利条件，但是否采纳，由人民法院决定。
（三）在收到起诉状副本之日起十日内提供证据
根据《关于行政诉讼证据若干问题的规定》的相关内容规定，当药品监督管理机关作为行政诉讼被告时，应当在收到人民法院起诉状副本之日起十日内，提供据以作出被诉行政处罚决定的全部证据和所依据的规范性文件。这是举证期限的规定。
根据现行《行政诉讼法》的相关内容规定：人民法院审理行政案件，应当收取行政诉讼费用。行政诉讼费用由败诉方承担，双方都有责任的由双方分担。在某些情况下，诉讼费用并不是由败诉当事人承担，而是根据案件的具体情况来规定。
由于行政诉讼法被称作为“民告官”的法律，因此，行政诉讼费的收取很低，一场行政诉讼下来，法院才收行政诉讼费50元。也就是说，无论是胜诉方或败诉方，就双方的财力而言，诉讼费可以忽略不计。
根据我国《行政诉讼法》的相关内容规定，公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，作出具体行政行为的行政机关是被告。经复议的案件，复议机关决定维持原具体行政行为的，作出原具体行政行为的行政机关是被告;复议机关改变原具体行政行为的，复议机关是被告。 两个以上行政机关作出同一具体行政行为的，共同作出具体行政行为的行政机关是共同被告。 由法律、法规授权的组织所作的具体行政行为，该组织是被告。由行政机关委托的组织所作的具体行政行为，委托的行政机关是被告。 行政机关被撤销的，继续行使其职权的行政机关是被告。
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